股權轉讓會涉及到稅收的問題，在股權轉讓的過程中，當事人雙方應格外注意稅務問題，避免稅收風險。那么，股權轉讓稅收風險有哪些?針對這些風險我們又該如何處理?下面小編為您帶來了相關的介紹。

一、并購時稅務風險承擔條款(法人)

在收購企業(yè)股權，收購方最擔心的是企業(yè)之前的稅務風險(尤其在收購個體工商戶或民營企業(yè)時)，如果收購以后被稅務機關稽查補稅，可能面臨巨額的補稅和罰款等。所以，收購方要求轉讓方承諾承擔之前的稅務風險，一些股權轉讓協(xié)議就寫上“標的企業(yè)股權轉讓日之前產生的任何補稅、滯納金、稅收違法的罰款由轉讓方承擔”。

但是，根據稅法的規(guī)定，如果標的企業(yè)產生補稅、滯納金、罰款，稅務機關處罰的對象是標的企業(yè)，這是一種行政責任，不會因雙方的民事合同約定而改變。

建議的表達方式：可以將表述轉化為“并購企業(yè)承擔的任何股權轉讓日之前的稅收補稅、滯納金、罰款，股權轉讓方保證向并購企業(yè)做出等額賠償”。通過合同條款，將補稅的行政責任轉化為雙方的民事關系。

二、轉讓方獲取的對賭補償的個人所得稅問題(自然人)

在投資或并購交易中，投資者為了維護自身的利益，防止投資時由于對被投資企業(yè)的估值過高而遭受損失，往往會通過“對賭條款”來對被投資企業(yè)的估值做出修正以保證自身的利益。如果被投資企業(yè)的業(yè)績達到預定或超過預定目標，投資者可能會以貨幣或股權等形式補償原股東。

根據股權轉讓所得個人所得稅管理辦法(試行)》的公告(國家稅務總局公告2014年第67號第9條的規(guī)定，“納稅人按照合同約定，在滿足約定條件后取得的后續(xù)收入，應當作為股權轉讓收入”。按此邏輯，轉讓方在獲取對賭協(xié)獲得的補償應調整股權轉讓收入的應納稅所得額并補繳個人所得稅。

三、股權交易中的稅務成本承擔責任主體

股權轉讓方如果是個人(包括境外個人)、境外企業(yè)(注：境內企業(yè)由于股權轉讓收益與公司的盈虧合并納稅，不涉及單獨計稅問題)，由于股權轉讓需要單獨計算納稅，合同中通常需要明確涉及的稅務成本由誰承擔，也就是轉讓對價是稅后的還是含稅的問題。

在實務中，股權轉讓合同通常喜歡寫“一切稅費由**方承擔”。其實，股權轉讓只涉及所得稅(個人：個人所得稅，境外企業(yè)：企業(yè)所得稅)和印花稅。通常合同只需要明確所得稅由哪一方承擔即可，根據稅法的規(guī)定，印花稅通常是雙方都要承擔的，股權轉讓應該是轉讓方取得收益承擔納稅義務。納稅義務由稅法規(guī)定，不能由民事合同自行約定，交易雙方自行約定納稅義務屬于違法、無效。

建議的表達方式：在合約中的表述改為“股權轉讓價格為稅后價格”。

四、自然人股權轉讓時法律手續(xù)不符合稅收法律規(guī)定

在實際中，許多自然人在轉讓股權時通常私自簽訂平價或折價的股權轉讓協(xié)議，在當地的工商部門辦理變更登記手續(xù)后不去稅務局備案，這個是不符合稅法規(guī)定的，會受到稅務的稽核和處罰。

自然人在轉讓股權后，應該將變更后的營業(yè)執(zhí)照，股權轉讓協(xié)議、銀行回單憑證等在稅務機關備案，如果不是平價轉讓的，還要申報個人所得稅。

五、申報的股權轉讓收入價格不公允

許多自然人為了少申報或不申報個人所得稅，通常會在合同中約定不符合獨立交易交易原則的條款，比如折價或平價轉讓，甚至有些新三板掛牌企業(yè)在轉股系統(tǒng)中以很低的價格轉讓，以規(guī)避所得稅。

67號文規(guī)定，被轉讓企業(yè)擁有土地、房屋等重大資產的，應以股權對應的凈資產的公允價值(而非賬面價值)為標準來衡量股權的轉讓價格是否偏低。如果符合67號文12條規(guī)定的情形，稅務機構可以認為股權轉讓收入明顯偏低，可以進行核定征收。

六、留存收益過高導致溢價過高多交企業(yè)所得稅

根據國稅函(2010)79號文的規(guī)定，企業(yè)轉讓股權收入，應于轉讓協(xié)議生效、且完成股權變更手續(xù)時，確認收入的實現。轉讓股權收入扣除為取得該股權所發(fā)生的成本后，為股權轉讓所得。企業(yè)在計算股權轉讓所得時，不得扣除被投資企業(yè)未分配利潤等股東留存收益中按該項股權所可能分配的金額。

建議：在發(fā)生股權轉讓時，可以先將留存收益進行分配(居民企業(yè)股東分配的股息、紅利等投資收益免稅)，降低凈資產，再轉讓股權，從而降低股權轉讓的價格和轉讓所得，介紹企業(yè)的所得稅。

股權轉讓的風險涉及到稅務方面的風險和合同方面的風險，法律雖然對股權轉讓中的各個事項都作了詳細的規(guī)定，但風險難以避免地會存在。通過以上對股權轉讓稅收風險有哪些這個問題的回答，相信大家都可以了解股權轉讓中的稅務問題了，只有對各項風險都作出提前的預見與防范，才能更好的避免風險的發(fā)生。