總的來講，要防范工程款糾紛應從以下幾個方面入手

1、慎重選擇合作伙伴。隨著市場競爭的日趨激烈，一些承包企業(yè)很難攬到工程，所以對工程項目格外珍惜，這容易形成一種志在必得的心理，這種心里促使對合作伙伴誠信度考察的忽視，則往往落得干了活拿不到錢的結(jié)局。慎重選擇合作伙伴是非常重要的，合作伙伴的資信能力對承包企業(yè)的權利實現(xiàn)是至關重要的，故必須對合作伙伴的情況要有所了解，主要包括合作伙伴的股東構(gòu)成，企業(yè)信譽如何，有無違約記錄，對外負債，主要固定資產(chǎn)現(xiàn)狀如何，項目資金的來源、到位及監(jiān)管情況等等。

2、審查建設手續(xù)。有些建設工程項目未經(jīng)有關部門審批或者建設方的建設意圖超越審批范圍，如果承包方不問青紅皂白匆忙承建此工程很可能陷于困境，為以后索要工程款造成障礙。例如，規(guī)劃部門規(guī)劃建五層，而發(fā)包方卻想建到五層以上，這樣，如果承包方按發(fā)包方意圖建設，建設過程中很可能遭到規(guī)劃部門勒令停工，承包方勢必進入僵局。再如，規(guī)劃部門規(guī)劃建五層，這樣，如果承包方按發(fā)包方意圖把樓建設到五層以上，事后，該工程被城建規(guī)劃部門勒令拆除，承包方主張五層以上部分的工程款就有了難度。

3、請專業(yè)人員把好合同關。合同是承包方實現(xiàn)權利的最重要的憑證，合同是否規(guī)范、表達是否準確、嚴密、詳細對承包人來講十分關鍵。有的人常常認為施工合同都是格式文本，沒有什么可以發(fā)揮的。其實，這種認識是不正確的，建設部推薦的格式文本是為了雙方訂立合同方便、規(guī)范，但格式合同里是很多可以選擇的條款，并且有些是空白條款待當事人根據(jù)自己的具體情況填寫。簽訂合同時一定要特別注意把工程款的支付方式、支付期限及違約責任約定清楚。

4、完善施工手續(xù)。相當一部分工程款糾紛的承包方由于手續(xù)不完善，無法取得證據(jù)，給對方可乘之機。這種情況下處理糾紛就很被動。故施工過程中，手續(xù)一定要完備。比如，工程圖紙設計的更改、選材的變更、施工項目的增加等變簽單一定要有對方施工代表、監(jiān)理的簽字。