一、科研機(jī)構(gòu)深化改革的目標(biāo)和方向
　?。ㄒ唬└母锏哪繕?biāo)。
　　按照實施科教興國戰(zhàn)略、加強(qiáng)科技創(chuàng)新、加速成果轉(zhuǎn)化的總要求，根據(jù)社會主義市場經(jīng)濟(jì)規(guī)律和科技自身發(fā)展規(guī)律，全面優(yōu)化科技力量布局和科技資源配置；加快國務(wù)院部門（單位）所屬科研機(jī)構(gòu)改革步伐，使其適應(yīng)市場需求，更好地為經(jīng)濟(jì)建設(shè)和社會發(fā)展服務(wù)；國家以支持項目為主，通過競爭擇優(yōu)方式扶持技術(shù)創(chuàng)新活動；國家財政科技投入集中用于應(yīng)由國家支持、亟需發(fā)展的領(lǐng)域和少數(shù)精干、高水平的重點(diǎn)科研機(jī)構(gòu)；建立“開放，流動，競爭，協(xié)作”的管理和運(yùn)行機(jī)制。
　?。ǘ└母锏姆较?。
　　對不同類型、分屬不同部門的科研機(jī)構(gòu)實行分類改革：
　　１．技術(shù)開發(fā)類科研機(jī)構(gòu)實行企業(yè)化轉(zhuǎn)制。
　　國家電力公司、中國石油化工集團(tuán)公司、中國石油天然氣集團(tuán)公司、中國建筑工程總公司、中國汽車工業(yè)總公司等企業(yè)所屬科研機(jī)構(gòu)已經(jīng)進(jìn)入企業(yè)，要辦理事業(yè)單位注銷手續(xù)；作為獨(dú)立企業(yè)法人的要辦理企業(yè)登記手續(xù)。
　　建設(shè)部、鐵道部、交通部、信息產(chǎn)業(yè)部、藥品監(jiān)管局等部門所屬技術(shù)開發(fā)類科研機(jī)構(gòu)，要通過轉(zhuǎn)為企業(yè)或進(jìn)入企業(yè)等方式向企業(yè)化轉(zhuǎn)制，與原部門脫鉤；為國家經(jīng)濟(jì)和社會發(fā)展提供重大基礎(chǔ)性或共性技術(shù)服務(wù)、無法得到相應(yīng)經(jīng)濟(jì)回報的個別科研機(jī)構(gòu)，通過調(diào)整結(jié)構(gòu)、優(yōu)化組合形成一支精干隊伍，這些科研機(jī)構(gòu)可以由原部門（單位）繼續(xù)按事業(yè)單位管理。承擔(dān)軍事科研任務(wù)的科研機(jī)構(gòu)，原則上也要向企業(yè)化轉(zhuǎn)制，具體轉(zhuǎn)制方式和管理體制另行制定。
　　２．社會公益類科研機(jī)構(gòu)分別不同情況實行改革。
　　國土資源部等部門所屬公益類研究和應(yīng)用開發(fā)并存的科研機(jī)構(gòu)，有面向市場能力的（占總數(shù)一半以上）要向企業(yè)化轉(zhuǎn)制；以提供公益性服務(wù)為主的科研機(jī)構(gòu)，有面向市場能力的也要向企業(yè)化轉(zhuǎn)制；主要從事應(yīng)用基礎(chǔ)研究或提供公共服務(wù)、無法得到相應(yīng)經(jīng)濟(jì)回報、確需國家支持的科研機(jī)構(gòu)，仍作為事業(yè)單位，按非營利性機(jī)構(gòu)運(yùn)行和管理，其中具有面向市場能力的部分，也要向企業(yè)化轉(zhuǎn)制并逐步與原科研機(jī)構(gòu)分離。其他科研機(jī)構(gòu)要向中介服務(wù)方向發(fā)展。
　　按非營利性機(jī)構(gòu)管理和運(yùn)行的科研機(jī)構(gòu)，要優(yōu)化結(jié)構(gòu)、分流人員、轉(zhuǎn)變機(jī)制，按照總體上保留不超過３０％工作人員的要求，重新核定編制。
　?。常斦俊⑽幕康炔块T所屬以社會科學(xué)（含經(jīng)濟(jì)、文化、法律等）領(lǐng)域研究為主的科研機(jī)構(gòu)，按照國家關(guān)于其他類型事業(yè)單位的改革部署進(jìn)行改革。
　?。矗锌圃核鶎倏蒲袡C(jī)構(gòu)，按照本實施意見確定的基本原則進(jìn)行改革。具體工作要結(jié)合經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)的“知識創(chuàng)新工程”試點(diǎn)方案進(jìn)行。
　?。担訌?qiáng)科研和教育的結(jié)合，鼓勵科研機(jī)構(gòu)進(jìn)入高等學(xué)校、與高等學(xué)校合并或開展多種形式的合作。

　二、支持科研機(jī)構(gòu)深化改革的政策
　?。ㄒ唬┺D(zhuǎn)為企業(yè)或進(jìn)入企業(yè)的科研機(jī)構(gòu)，執(zhí)行科技部等部門發(fā)布的《關(guān)于國家經(jīng)貿(mào)委管理的１０個國家局所屬科研機(jī)構(gòu)管理體制改革的實施意見》（國科發(fā)政字〔１９９９〕１４３號）、《關(guān)于國家經(jīng)貿(mào)委管理的１０個國家局所屬科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制中有關(guān)國有資本核定問題的通知》（財管字〔１９９９〕２７６號）、《關(guān)于國家經(jīng)貿(mào)委管理的１０個國家局所屬科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制后稅收征收管理問題的通知》（國稅發(fā)〔１９９９〕１３５號）、《關(guān)于國家經(jīng)貿(mào)委管理的１０個國家局所屬科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制后有關(guān)養(yǎng)老保險問題的通知》（勞社部發(fā)〔２０００〕２號）中所規(guī)定的政策。涉及實施時限的，由發(fā)文單位作相應(yīng)的變通處理。
　　（二）按非營利性機(jī)構(gòu)運(yùn)行和管理的科研機(jī)構(gòu)，要在人事制度、分配制度等方面進(jìn)行改革，按照新的機(jī)制和管理制度運(yùn)行，承擔(dān)政府、企業(yè)和其他社會組織委托的任務(wù)，按有關(guān)規(guī)定為社會提供有償服務(wù)，提高面向市場服務(wù)的能力，最終實現(xiàn)經(jīng)營管理的社會化；主管部門要轉(zhuǎn)變管理方式，變直接領(lǐng)導(dǎo)為通過參加機(jī)構(gòu)理事會參與重大問題決策。這類科研機(jī)構(gòu)達(dá)到改革目標(biāo)、經(jīng)有關(guān)部門驗收并重新核定編制后，國家對其增加人均事業(yè)費(fèi)投入。要加強(qiáng)科研項目經(jīng)費(fèi)的投入和管理，按照競爭、擇優(yōu)的原則對優(yōu)選的科研項目加強(qiáng)支持。
　?。ㄈ┻M(jìn)入高等學(xué)校或與高等學(xué)校合并的科研機(jī)構(gòu)，其人均事業(yè)費(fèi)低于高等學(xué)校標(biāo)準(zhǔn)的，由負(fù)責(zé)撥付費(fèi)用的一級財政予以補(bǔ)足。

　三、改革的組織實施
　　科研機(jī)構(gòu)管理體制改革事關(guān)科技工作、經(jīng)濟(jì)工作和社會穩(wěn)定的全局。國務(wù)院各部門（單位）要高度重視，根據(jù)本實施意見提出切實可行的改革方案，明確所屬科研機(jī)構(gòu)的具體改革方向和任務(wù)，制定保障改革順利實施的措施和辦法，及時解決實踐中出現(xiàn)的新情況、新問題，充分調(diào)動科研機(jī)構(gòu)和廣大科技人員的積極性和創(chuàng)造性。
　?。ㄒ唬┛蒲袡C(jī)構(gòu)管理體制改革以國務(wù)院各部門（單位）為主具體實施。向企業(yè)化轉(zhuǎn)制的科研機(jī)構(gòu)要于２０００年９月底前完成交接，２０００年１２月底前完成企業(yè)登記。社會公益類科研機(jī)構(gòu)按照非營利性機(jī)構(gòu)運(yùn)行和管理的試點(diǎn)工作，在本實施意見發(fā)出后啟動，總體方案要在２０００年１２月底前確定，２００１年全面實施。
　?。ǘ┙?jīng)國務(wù)院授權(quán)，由科技部牽頭，會同國務(wù)院有關(guān)部門（單位）做好科研機(jī)構(gòu)管理體制改革的協(xié)調(diào)、審核工作。國務(wù)院部門（單位）所屬科研機(jī)構(gòu)的改革方案經(jīng)科技部、財政部、中編辦審核批準(zhǔn)，報國務(wù)院備案后組織實施?？萍疾控?fù)責(zé)改革方案實施的檢查督導(dǎo)工作，統(tǒng)籌協(xié)調(diào)社會公益類科研機(jī)構(gòu)分類改革的方案制定、試點(diǎn)和全面啟動工作。
　　科技部會同國務(wù)院有關(guān)部門制定非營利性科研機(jī)構(gòu)的有關(guān)政策和運(yùn)行管理規(guī)范，定期評估其工作績效。
　?。ㄈ﹪鴦?wù)院有關(guān)部門要根據(jù)科研機(jī)構(gòu)管理體制改革的新形勢，改革政府科技經(jīng)費(fèi)投入方式，建立國家科技計劃項目招投標(biāo)制度，對國家科研計劃項目的實施逐步實行課題制管理，使科研機(jī)構(gòu)管理體制改革、調(diào)整后的科技實力和創(chuàng)新能力得到進(jìn)一步加強(qiáng)。
　?。ㄋ模┑胤秸块T所屬科研機(jī)構(gòu)體制改革工作，由各地方政府參照本實施意見進(jìn)行。