財政部、國家稅務(wù)總局《關(guān)于貫徹落實<中共中央國務(wù)院關(guān)于加強技術(shù)創(chuàng)新，發(fā)展高科技，實現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化的決定>有關(guān)稅收問題的通知》（財稅字[1999]273號）下發(fā)后，各地在執(zhí)行過程中提出了一些問題。為了更好地貫徹落實中共中央、國務(wù)院有關(guān)文件精神，加強企業(yè)所得稅征收管理，經(jīng)研究，現(xiàn)就有關(guān)問題補充通知如下：

　　一、科研機構(gòu)轉(zhuǎn)制問題

　?。ㄒ唬┲醒胫睂倏蒲袡C構(gòu)以及省、地（市）所屬的科研機構(gòu)轉(zhuǎn)制后，凡符合企業(yè)所得稅納稅人條件的，自1999年10月1日起至2003年底止，免征企業(yè)所得稅。

　?。ǘ┣翱钏缚蒲袡C構(gòu)不包括1999年10月1日以前已經(jīng)轉(zhuǎn)制、已實行企業(yè)化管理和已并入企業(yè)的科研機構(gòu)，也不包括所有從事社會科學(xué)研究的科研機構(gòu)。

　?。ㄈ┫硎苌鲜銎髽I(yè)所得稅優(yōu)惠政策的科研機構(gòu)，需持轉(zhuǎn)制變更后的企業(yè)工商登記材料報所在地主管稅務(wù)機關(guān)，并按規(guī)定辦理有關(guān)減免稅手續(xù)。

　?。ㄋ模┺D(zhuǎn)制的科研機構(gòu)隸屬關(guān)系如有變更，變更后企業(yè)所得稅的收入歸屬、征收管理范圍、欠稅處理和稅務(wù)變更手續(xù)，比照《國家稅務(wù)總局關(guān)于國家經(jīng)貿(mào)委管理的10個國家局所屬科研機構(gòu)轉(zhuǎn)制后稅收征收管理問題的通知》（國稅發(fā)[1999]135號）的有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。

　　二、軟件開發(fā)企業(yè)的工資稅前扣除問題

　?。ㄒ唬┸浖_發(fā)企業(yè)實際發(fā)放的工資總額，在計算應(yīng)納稅所得額時準予扣除。

　?。ǘ┣翱钏杠浖_發(fā)企業(yè)必須同時具備下列條件：

　　1.省級科學(xué)技術(shù)部門審核批準的文件、證明；

　　2.自行研制開發(fā)為滿足一定的用戶需要而制作用于銷售的軟件，軟件產(chǎn)品的形式是記載有計算機程序及其有關(guān)文檔的存儲介質(zhì)（包括軟盤、硬盤和光盤等）；

　　3.以軟件產(chǎn)品的開發(fā)生產(chǎn)為主營業(yè)務(wù)，符合企業(yè)所得稅納稅人條件；

　　4.年銷售自產(chǎn)軟件收入占企業(yè)年總收入的比例達到35%以上；

　　5.年軟件技術(shù)轉(zhuǎn)讓收入占企業(yè)年總收入的比例達到50%以上（須經(jīng)技術(shù)市場合同登記）；

　　6.年用于軟件技術(shù)的研究開發(fā)經(jīng)費占企業(yè)年總收入的5%以上。

　　三、社會力量資助科研機構(gòu)、高等學(xué)校的研究開發(fā)經(jīng)費稅前扣除問題

　　（一）社會力量對科研機構(gòu)、高等學(xué)校研究開發(fā)經(jīng)費的稅前扣除，是指企業(yè)單位（不含外商投資企業(yè)和外國企業(yè)）、事業(yè)單位、社會團體、個人和個體工商業(yè)戶（下同），對非關(guān)聯(lián)的科研機構(gòu)和高等學(xué)校研究開發(fā)新產(chǎn)品、新技術(shù)、新工藝所發(fā)生的研究開發(fā)經(jīng)費的資助。

　?。ǘ┢髽I(yè)單位（不含外商投資企業(yè)和外國企業(yè)）、事業(yè)單位、社會團體在繳納企業(yè)所得稅時，經(jīng)主管稅務(wù)機關(guān)審核確定，其資助支出可以全額在當年應(yīng)納稅所得額中扣除。當年度應(yīng)納稅所得額不足抵扣的，不得結(jié)轉(zhuǎn)抵扣。

　?。ㄈ﹤€人的所得（不含偶然所得，經(jīng)國務(wù)院財政部門確定征稅的其他所得）用于資助的，可以全額在下月（工資、薪金所得）或下次（按次計征的所得）或當年（按年計征的所得）計征個人所得稅時，從應(yīng)納稅所得額中扣除，不足抵扣的，不得結(jié)轉(zhuǎn)抵扣。

　?。ㄋ模┥鐣α抠Y助研究開發(fā)經(jīng)費的支出，是指納稅人通過中國境內(nèi)非營利的社會團體、國家機關(guān)向科研機構(gòu)和高等學(xué)校研究開發(fā)經(jīng)費的資助。納稅人直接向科研機構(gòu)和高等學(xué)校的資助不允許在稅前扣除。

　　（五）企業(yè)等社會力量向科研機構(gòu)和高等學(xué)校資助研究開發(fā)經(jīng)費申請抵扣應(yīng)納稅所得額時，須提供以下資料：

　　1.中國境內(nèi)非營利的社會團體、國家機關(guān)出具的收到資助資金和用途的書面證明；

　　2.科研機構(gòu)和高等學(xué)校研究開發(fā)新產(chǎn)品、新技術(shù)、新工藝的項目計劃；

　　3.科研機構(gòu)和高等學(xué)校開具的資金收款證明；

　　4.稅務(wù)機關(guān)要求提供的其他相關(guān)資料。納稅人不能提供以上資料的，稅務(wù)機關(guān)不予受理。

　　四、本通知自1999年10月1日起開始執(zhí)行。