根據(jù)第八屆全國人民代表大會第一次會議批準的國務院機構改革方案，保留審計署。按照轉(zhuǎn)變職能，理順關系，精兵簡政，提高效率的原則和黨的十四大關于強化審計監(jiān)督的精神，確定審計署的職能配置、機構設置和人員編制。

　　一、職能轉(zhuǎn)變

　　審計署職能轉(zhuǎn)變的重點是：強化審計監(jiān)督職能，維護國家財經(jīng)法規(guī)，監(jiān)督國家資金的管理和使用，充分發(fā)揮其在國民經(jīng)濟宏觀管理中的作用；按照統(tǒng)一領導、分級審計的原則，加強對國務院各部門特別是經(jīng)濟管理部門和省級人民政府財政收支的直接審計。減少統(tǒng)一部署的審計項目，地方的審計項目一般由地方審計機關根據(jù)政府的要求自行安排；改革企業(yè)審計辦法，減少對企業(yè)的直接審計，重點審計占有、使用國有資產(chǎn)數(shù)額較多和接受國家財政補貼較多的中央部屬國有企業(yè)，對其他中央部署國有企業(yè)逐步改為由審計事務所、會計師事務所進行審計，審計機關在必要時進行抽審。

　　二、主要職責

　　依據(jù)憲法規(guī)定，審計署對國務院各部門和地方各級人民政府的財政收支，對國家的財政金融機構和企事業(yè)組織的財務收支，進行審計監(jiān)督。

　　根據(jù)《中華人民共和國審計條例》的規(guī)定，審計監(jiān)督工作實行統(tǒng)一領導、分級審計的原則。審計署的主要職責是：

　?。ㄒ唬┙M織領導全國的審計工作，研究制訂審計法律、法規(guī)和審計工作的方針、政策，確定工作重點，制定審計業(yè)務規(guī)章制度，組織某些行業(yè)和專項資金審計。

　　（二）直接進行下列審計：1.國務院各部門和接受中央財政撥款單位的財政、財務收支及其資金使用效益。

　　2.國務院各部門和省級人民政府預算外財政資金的收支及其使用效益。

　　3.國家金融機構信貸計劃的執(zhí)行及其結(jié)果。

　　4.國務院管理的經(jīng)濟實體和部委歸口管理、財務單列經(jīng)濟實體的盈虧真實和國有資產(chǎn)的保值增值。

　　5.國家重點建設項目的資金來源、使用情況和經(jīng)濟效益。

　　6.省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市的財政收支。

　　7.國務院各部門、經(jīng)濟實體、專業(yè)銀行和省、自治區(qū)、直轄市、計劃單列市借用的國外資金和使用的國外援助資金。

　　8.國家計劃、金融部門對社會集資和債券發(fā)行的審批情況。

　　（三）組織駐國務院各部門和駐地方派出機構，對國務院各部門、經(jīng)濟實體所屬的企事業(yè)組織（包括有國有資產(chǎn)的中外合資經(jīng)營企業(yè)、中外合作經(jīng)營企業(yè)、國內(nèi)聯(lián)營企業(yè)和其他企業(yè)），國家金融機構的分支機構，國家重點建設項目等進行審計。

　?。ㄋ模┨幚淼胤奖粚徲媶挝粚κ〖墝徲嫏C關審計決定的申訴。

　?。ㄎ澹﹨f(xié)同地方辦理省級審計機關負責人的任免事項。

　?。徲嬛邪l(fā)現(xiàn)宏觀管理方面的問題，進行專題審計并向國務院反映情況，提出建議。

　?。ㄆ撸┲笇Ш捅O(jiān)督注冊審計師協(xié)會和審計事務所。

　?。ò耍┲笇?nèi)部審計工作。

　　（九）組織開展審計領域的國際交流活動。

　　（十）承辦國務院交辦的其他審計事項。

　　三、內(nèi)設機構

　　根據(jù)上述職責，審計署設14個職能司和機關黨委。

　　（一）辦公廳負責政策研究，草擬、修改重要文件，反映情況，編輯內(nèi)部刊物、審計信息，承擔對外宣傳和文書、檔案、信訪工作，負責同駐部門、地方派出機構進行聯(lián)系和機關行政管理等工作。

　?。ǘ┚C合司負責編制署機關和派駐機構的審計工作計劃，匯編全國審計工作計劃和審計工作統(tǒng)計報表；劃分審計范圍，協(xié)調(diào)各業(yè)務司和派駐機構的審計事項；管理審計事業(yè)經(jīng)費；對署所屬單位的財務收支進行審計等工作。

　?。ㄈ┓ㄒ?guī)司負責草擬審計法規(guī)，復核重大審計事項決定，參與研究財政經(jīng)濟法規(guī)等工作。

　?。ㄋ模┴斦徲嬎矩撠煂徲嬍　⒆灾螀^(qū)、直轄市和計劃單列市的預算收支和預算外財政資金的收支及其使用效益以及地方財稅管理情況。

　?。ㄎ澹┙鹑趯徲嬎矩撠煂徲媷医鹑跈C構信貸計劃的執(zhí)行及其結(jié)果。根據(jù)署的計劃，具體組織駐地方派出機構對國家金融機構在地方的分支機構和各地區(qū)、有關部門的債券發(fā)行、社會集資審批進行審計。

　?。┬姓聵I(yè)審計司負責審計國務院政法、文教等部門和直屬機構、辦事機構、事業(yè)單位的財政、財務收支及其資金使用效益。根據(jù)署的計劃，具體組織駐部門、地方派出機構對這些部門管理的某些專項資金進行審計。

　　（七）工業(yè)交通審計司負責審計國務院工業(yè)、交通部門和所屬經(jīng)濟實體、部委歸口管理財務單列經(jīng)濟實體的財政、財務收支及其經(jīng)濟效益和國有資產(chǎn)的保值增值。根據(jù)署的計劃，具體組織駐部門、地方派出機構對工業(yè)、交通部門的直屬單位進行某些行業(yè)審計、專項資金審計和專題審計調(diào)查。

　　（八）商貿(mào)審計司負責審計國務院國內(nèi)貿(mào)易、對外貿(mào)易經(jīng)濟合作等部門和所屬經(jīng)濟實體、部委歸口管理財務單列經(jīng)濟實體的財政、財務收支及其經(jīng)濟效益和國有資產(chǎn)的保值增值。根據(jù)署的計劃、具體組織駐部門、地方的派出機構對內(nèi)貿(mào)、外貿(mào)部門的直屬單位進行某些行業(yè)審計、專項資金審計和專題審計調(diào)查。

　?。ň牛┕潭ㄙY產(chǎn)投資審計司負責審計國務院各部門管理的固定資產(chǎn)投資、施工企業(yè)的財務收支及其經(jīng)濟效益。根據(jù)署的計劃，具體組織駐地方派出機構對國家重點建設項目的資金來源、使用情況和經(jīng)濟效益進行審計。

　　（十）農(nóng)業(yè)審計司負責審計國務院農(nóng)業(yè)、林業(yè)、水利部門的財政、財務收支及其資金使用效益。根據(jù)署的計劃，具體組織駐部門、地方派出機構和地方審計機關對農(nóng)業(yè)、林業(yè)、水利部門管理的某些專項資金進行審計和專題審計調(diào)查。

　?。ㄊ唬┩赓Y運用審計司負責審計國務院各部門和省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市借用的國外資金和使用的國外援助資金。根據(jù)署的計劃，具體組織駐地方派出機構和地方審計機關對世界銀行、亞洲開發(fā)銀行等國際金融組織的貸款項目進行審計。

　?。ㄊ徲嫻芾硭矩撠煂Φ胤綄徲嫻ぷ鞯臋z查；指導內(nèi)部審計工作；通過注冊審計師協(xié)會指導、監(jiān)督審計事務所和注冊審計師的工作。

　?。ㄊ┤耸陆逃矩撠熮k理署機關、派出機構、事業(yè)單位的干部調(diào)配、任免、工資福利、專業(yè)技術職稱考評；同地方協(xié)商省級審計機關負責人的任免事項；編制審計系統(tǒng)的干部教育規(guī)劃，指導干部培訓工作。

　　（十四）外事司負責辦理署機關及直屬單位人員出國考察、訪問的有關事項，接待外國審計機關來訪團組，組織專家講學，同外國審計機關、國際審計組織進行聯(lián)系。

　?。ㄊ澹C關黨委負責署機關和在京直屬單位的黨群工作。

　　四、駐國務院各部門派出機構

　　審計署在國務院三十七個部門設立審計派出機構，根據(jù)署的授權，負責審計所在部門在京的直屬企事業(yè)組織（少數(shù)部門審計全系統(tǒng)的直屬企事業(yè)組織）的財務收支，調(diào)查行業(yè)經(jīng)濟效益，指導行業(yè)的內(nèi)部審計工作。駐部門派出機構，實行審計署和駐在部門雙重領導，以審計署領導為主的體制。

　　五、人員編制和領導職數(shù)

　　審計署機關行政編制為475名，駐國務院各部門派出機構行政編制為369名（另有45名事業(yè)編制），共844名。其中，審計長1名，副審計長4名，現(xiàn)有超配的1名副審計長，作為過渡，調(diào)離或退下來后不再增補。司級領導職數(shù)47名（含機關黨委專職副書記2名；財政、金融、固定資產(chǎn)投資審計司3個司按1正3副配備）。駐國務院各部門派出機構司級領導職數(shù)，平均按1正1副配備。

　　經(jīng)檢、監(jiān)察等派駐機構和后勤、老干部服務機構及編制，按有關規(guī)定另行核定。